מרפאת צער בעלי חיים ממוקמת בתלפיות ומטפלת בבעלי חיים נטושים שנפגעו: כלבים משוטטים שחלו בהעדר מי שיטפל בהם, חתולים שנפגעו ממכוניות חולפות וכד'. המרפאה מאובזרת במכשור רפואי רב, ובעת הצורך – מגיעים רופאים מומחים למרפאה לצורך אבחון וטיפול בבעיות מורכבות.

הואיל ועמותת צער בעלי חיים מאמינה הצורך לבצע כמה שיותר ניתוחי עיקור וסרוס – גם במרפאה ניתן לבצע ניתוחים שכאלו במחירים מסובסדים.