האגודה לצער בעלי חיים ירושלים הוקמה בשנות ה-40 של המאה הקודמת ועדויות על פעילות מאורגנת למען רווחתם של בעלי החיים קיימות עוד מהתקופה העותמאנית.

ביום 14/09/1983, ז' תשרי התשמ"ד, נרשמה העמותה ברשם העמותות והפכה לעמותה רשמית בישראל.

העמותה פועלת בירושלים וסביבתה לאור המטרות הבאות:

• להוות מקלט ובית מחסה זמני לבעלי חיים נטושים ו/או בעלי חיים פגועים פיזית או נפשית, תוך מתן מענה רפואי.

• מציאת בתים מאמצים לבעלי החיים.

• עידוד לעיקור וסירוס של בעלי החיים.

• מניעת אלימות נגד בעלי חיים והתעללות בהם.

• פעילות הסברה וחינוך להקניית מודעות ליחס הומני לבעלי חיים בכלל לצורך ביחס נאות לחיות מחמד בפרט.

• כל פעילות אחרת לרווחת בעלי החיים ולקידום מטרות העמותה.
  
  פעילות זאת נעשית באמצעות הפעלת בית מחסה לכלבים וחתולים המונה מעל 200 בעלי חיים, מרפאה וטרינרית (הכוללת חדר ניתוח) בבית המחסה ומרפאה וטרינרית המעניקה שירות לקהל הרחוב, לחיות הבית, ולחתולי רחוב.

לעמותה אישור ניהול תקין לשנים 2025-2026 ואישור 46 א' ותרומה לעמותה מזכה בזיכוי מס.